休眠会社の確定申告書・決算書の書き方（国税局から電話で教えてもらったこともメモ）

実は私、コロナ前に合同会社を作っていまして、現在は休眠中です。活動してないので売上はゼロ。

休業中でも必ず確定申告書を提出しなければいけません。

なんと、2年連続で提出を忘れていました。言い訳にはなりますが全く会社としては活動してないため、存在自体忘れていた次第です。でも申告は義務なので絶対やらなければいけません！

それで、痺れを切らしたかのように国税局から電話がありました。見知らぬ番号から着信があったので調べてみたらなんと「⚪︎⚪︎国税局」で冷や汗ものです。

「２年連続で提出しなかったので青色取り消しねー。今年は白色で出してねー。次忘れたらやばいことになるよ」という内容でした。でも、国税局本体からじゃなくて、「国税局業務センター」という事務作業だけ請け負っているところからの電話でした。

急いで申告をして困った経験から、休業会社の決算書・確定申告書の書き方と手続きの方法を解説します。

当たり前だけど、青色取り消しになったら白色になります。その後、再度、青色申告申請書を提出しないといけません。
期限は青色申告書による申告をしようとする年の3月15日まで
 申請書はこちらから

【結論】休業会社の確定申告はどこに何を出す？

先に結論をまとめます。
休業中の法人の申告は、提出先が3つに分かれています。

※東京23区内の法人は例外で、②③が都税事務所に一本化されるので提出先は2つになります。

②③については、休業届を出している法人は「申告不要」という運用の自治体もあります（私の場合、県も市も不要でした。詳しくは後述）。ここを混同すると、私と同じ失敗をします。

私の失敗談：第六号様式を税務署に送ったら電話が来た

3年前に申告したとき、私は第六号様式（県民税の申告書）も一緒に税務署へ郵送しました。すると税務署から電話がかかってきて、

「第六号様式・県民税の確定申告書は税務署に関係ないから役所に送ってねー、こっちに届いた分は破棄しとくねー」

と言われました。国税と地方税は、書類も提出先も完全に別物なんです。他のサイトには「国税と地方税で別々の場所に申告する」と書いてあってまさにその通り。私は、当時は「税務署だけでいいのでは？」と思っていたので、正しくは別々でした。

では地方税は毎年どうすればいいのか？　これは自治体によって扱いが違うので、「地方税はどうする？」で詳しく説明します。

国税の申告方法①：e-Taxで申告（おすすめ・2026年はこれでやりました）

2026年の申告はe-Tax（Web版）で送信しました。

結論から言うと、休業中の法人ならe-Taxの方が圧倒的にラクです。

• 印刷不要
• ハンコ不要
• クリアファイルも封筒も切手も不要
• 数字はすべて0円で入力して送信するだけ

郵送のときにやっていた「空欄に『休業中』と書く」作業が、e-Taxでは「0円と入力して送信」に変わるだけ。売上も費用もゼロの休眠会社なら、入力する数字がそもそもないので、慣れれば郵送より短時間で終わります。

方法①：e-Tax（Web版）で申告する手順

1. e-Taxソフト（WEB版）にログイン（利用者識別番号が必要です。未取得の場合は先に開始届出書を提出）
2. 法人税の申告書を選択
3. 法人の基本情報を入力
4. 金額欄はすべて「0」で入力
5. 送信して完了

初回は利用者識別番号の取得などの準備がありますが、2年目以降は本当に「ログインして0を入れて送信」だけです。

※スクリーンショット付きの詳しい手順は、来年の申告時に画面を撮って追記予定です。

パソコン操作が苦手な方や、e-Taxの初期設定が面倒な方は、これまで通り郵送でも問題ありません。郵送の手順はこの下で解説しています。

国税の申告方法②：郵送で申告

パソコンでの申告が苦手な方は、従来どおり郵送でも問題ありません。私も以前はこの方法でやっていました。

税務署に郵送するもの

①法人税確定申告書・別表一

（国税局サイトに飛びます）

↑からPDFをダウンロードして、印刷します。

書き方は、氏名などの必要事項を書いて、数字を書く欄に「休業中」と書くだけです。

法人のハンコ押してくださいね。

ちなみに前回申告していなかったせいで、今回は「白色申告」しろと指示があったので白色の用紙になってます。

皆さんはお間違えのないよう、青色で印刷してください。

②損益計算書

他サイトで見つけた雛形を使っています。金額はゼロでOK！

③貸借対照表

これは、休眠に入る前のものを日付を変えるだけです。

休業会社の確定申告書類の郵送方法

作成した４枚の紙を、透明なクリアファイルを持ってたのでそれに入れて封筒に入れ、郵送しました。

参考サイト：https://kigyo.gmo/magazine/accounting/list/tax-return-mailing/

※　ゆうパック、ゆうメール、ゆうパケットでは、信書を送付することはできません。

地方税を申告する方法

私は申告してないのですが、やり方としては国税と同じで、電子申告か郵送です。

・地方税の電子申告は「eLTAX（エルタックス）」

郵送するときは、書類に「休業中」とかいて送るだけと思います。

法人は休眠中、個人事業で活動している方へ

法人のほうは「0円で送信するだけ」で終わりですが、フリーランス・個人事業主としての確定申告はそうはいきません。売上も経費もあるので、帳簿づけが必要です。

私は個人事業の確定申告に「やよいの青色申告オンライン」を使っています。

正直な感想を言うと、簿記の知識がなくても銀行口座やカードを連携すれば取引が自動で入ってくるので、デザイナーの私でも申告書まで作れています。凝った機能は使いこなせていませんが、フリーランスの申告に必要な範囲なら十分でした。

セルフプランなら1年間無料で使えるので、法人を休眠させてフリーランスに移行した方は、最初の申告をこれで乗り切るのがコスパ的におすすめです。1年使ってみて、合わなければやめればいいだけなので。

無料で使える「やよいの青色申告 オンライン」

事業を再開するときは？

事業を再開すると、当然ながら取引が発生するので「0円で送信するだけ」というわけにはいかなくなります。そこからは会計ソフトで帳簿をつけることになります。

法人向けなら「弥生会計 Next」が無料体験できるので、再開のタイミングで試してみるのがいいと思います。休眠中から慌てて契約する必要はまったくありません。必要になってからで十分です。

弥生会計 Next

休眠会社の確定申告でよくある質問

申告しないとどうなる？

税額はゼロなので追徴のような実害はすぐには出ませんが、2期連続で申告しないと青色申告が取り消されます（私はこれで実際に取り消されて、国税局から電話が来ました…）。青色が取り消されると、赤字の繰越（繰越欠損金）が使えなくなり、再申請しても1年間は青色に戻れません。将来事業を再開する可能性が少しでもあるなら、毎年出しておくのが安全です。

消費税の申告は必要？

休眠中は課税取引がないので、消費税の申告義務は基本的にありません（心配な方は税務署に確認を）。

均等割（法人住民税）は払わないといけない？

均等割は本来、所得ゼロでもかかる税金ですが、休業届を出していれば減免・免除される自治体が多いです。ただし運用は自治体によって違い、別途「減免申請」が必要なところもあります。お住まいの県税事務所・市区町村に電話で確認してください。

何年も放置するとどうなる？

税務署への申告とは別の話として、最後の登記から12年間、登記をしないままだと法務局の職権で「みなし解散」の登記がされることがあります（株式会社の場合）。役員の任期満了時の変更登記も休眠中でも必要なので、登記関係だけは放置しないよう注意してください。

事業を再開するときは？

税務署には通常どおり申告すればOK。都道府県・市区町村には「異動届出書」で事業再開を届け出ます。

休業会社の確定申告まとめ

休業会社の確定申告まとめになります。

最初はめんどくさいですけど、e-Taxが一番楽でした。

どなたかの参考になれば幸いです。